🧬 یک قدم جدید در تشخیص بیماریهای نادر با RNA-seq 🔬 مقالهای جدید در Science Advances روشی به نام S…
انتشار: 2026/08/19 15:24 UTCدریافت: 2026/08/22 12:06 UTCآخرین مشاهده: 2026/08/22 12:06 UTC
🧬 یک قدم جدید در تشخیص بیماریهای نادر با RNA-seq 🔬 مقالهای جدید در Science Advances روشی به نام STRIPE معرفی کرده که با ترکیب Targeted RNA-seq و Long-read sequencing، امکان بررسی دقیقتر اثر واریانتهای ژنتیکی بر RNA را فراهم میکند. ❓ چرا این روش اهمیت دارد؟ در بسیاری از بیماران مبتلا به بیماریهای نادر، حتی با WES/WGS هم علت ژنتیکی بیماری مشخص نمیشود. یکی از مشکلات این است که پیدا کردن یک واریانت، لزوماً نشان نمیدهد که آن واریانت در سطح RNA چه اثری ایجاد کرده است. اینجاست که Long-read RNA-seq وارد میشود؛ چون میتواند ترنسکریپتهای کامل را ببیند و اطلاعاتی دربارهی: 🔹 تغییرات splicing 🔹 isoformهای مختلف 🔹 بیان ژن 🔹 واریانتهای موجود در RNA 🔹 و ارتباط واریانت با haplotype ارائه دهد. 🧪 STRIPE چگونه کار میکند؟ بهجای اینکه کل transcriptome با عمق بالا توالییابی شود، ابتدا RNA مربوط به ژنهای موردنظر یک پنل بیماری بهصورت هدفمند غنیسازی شده و سپس با long-read sequencing بررسی میشود. این کار باعث میشود با هزینه و حجم داده کمتر، پوشش بسیار عمیقتری از ژنهای مهم به دست آید. 📊 نتایج مطالعه محققان STRIPE را روی ۸۸ فرد، شامل افراد سالم و بیماران مبتلا به دو گروه از بیماریهای نادر، آزمایش کردند. نتایج نشان داد که این روش: ✅ واریانتهای بیماریزای شناختهشده را بهدرستی شناسایی کرد. ✅ اثر واقعی بسیاری از واریانتها روی RNA را مشخص کرد. ✅ در تعدادی از واریانتهای splice-site، اختلالات پیچیدهتری از آنچه انتظار میرفت نشان داد. ✅ به تفسیر Variants of Uncertain Significance (VUS) کمک کرد. ✅ و مهمتر از همه، در ۵ بیمار که قبلاً تشخیص ژنتیکی نداشتند، واریانتهای بیماریزا را شناسایی کرد. (PubMed) 💡 یکی از یافتههای جالب مطالعه این بود که برخی واریانتهای donor splice site میتوانند باعث فعال شدن cryptic polyadenylation sites داخل اینترون شوند؛ در نتیجه RNA زودتر از موعد خاتمه پیدا میکند. این نوع اثرات ممکن است با روشهای معمول بهسادگی قابل مشاهده نباشند. 🎯 جمعبندی STRIPE نشان میدهد که برای تشخیص بیماریهای نادر، فقط دانستن «چه واریانتی وجود دارد؟» کافی نیست؛ گاهی باید ببینیم: این واریانت دقیقاً با RNA چه میکند؟ Targeted long-read RNA-seq میتواند پلی بین ژنوتیپ → اثر مولکولی → تشخیص بیماری ایجاد کند و در آینده به تفسیر VUS و افزایش diagnostic yield کمک کند. 📌 Reference: Wang R, et al. Targeted long-read RNA sequencing for rare disease diagnosis and variant interpretation. Science Advances. 2026;12(16):eady9895. (PubMed) #Genomics #RNAseq #LongReadSequencing #RareDisease #GeneticDiagnosis #Splicing #VariantInterpretation #STRIPE🔮 با #آکادمیک #ساینس همراه باشید🍂💯اطلاعات بیشتر در ⬅️ 👈 🌐 @academic_science
